スピンオフ8回目 ゲノム進化を追え！
作権の表記
使用した音楽素材の著作権
BGM：hitoshi by Senses Circuit, https://www.senses-circuit.com から以下の曲を使用しています
ジングル：ジングル：EDM風 ジングル・アイキャッチ by ambience
本編
本文中で話している、全般的なコロナウィルスの特徴は「日本ウィルス学会」の下記の論文を参照しています。
http://jsv.umin.jp/journal/v61-2pdf/virus61-2_205-210.pdf
取り上げているwebサイトはhttps://nextstrain.org/です。このサイトの使用しているデータは、https://www.gisaid.org/に基づいています。nextstrain.orgの活動はオープン・ソースであり、GitHubに公開されています。
下の図は、日本の横浜沖に停泊していたクルーズ船の「ダイヤモンド・プリンセス号」の感染者のゲノムからたどった系統図です。一説には(webニュースでは), 感染の元はヨーロッパでは？という情報があります。ただ、私はゲノム型が起源を遡っていき、その対象のウィルスを持っていた人が、果たしてヨーロッパを旅している途中で感染したかまでは断定はできないように思います。
次の図では、「PLAY」ボタンを押すと、時系列でどのように感染が広がったかを観察できます。
こちらの図は、日本にやって来た感染経路が複数個あったことを示唆しています。おそらく、解析データの無い北海道の事例を含めると、もっと多くの侵入経路があって、ウィルスが日本にやって来たのだろうと思います。
